危害韭菜常见病虫有疫病、灰霉病、锈病、菌核病、葱蚜、韭菜迟眼蕈蚊等。
（1）韭菜疫病
韭菜疫病多发生在高温多雨的夏季，根、茎、叶、花苔均可受害，尤以地下的根状茎受害最重。病叶多从中下部开始发病。
防治方法：发病初期及时喷药，有效药剂有25%甲霜灵可湿性粉剂600—1000倍液，58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，除喷雾施药外，在栽植时，用药液蘸根或雨季始用期用药液灌根。
（2）锈病
韭菜疫病主要危害叶片，严重时可危害花苔。氮肥过多、钾肥不足时发病重。
防治方法： ①轮作，减少菌源累积；合理密植，做到通风透光良好；雨后及时排水，防止田间湿度过高；采用配方施肥技术，多施磷钾肥，提高抗病力。
②收获时，尽可能低割，注意清洁畦面，喷洒45%微粒硫磺胶悬剂400倍液。
③发病初期及时喷洒15%三唑酮可湿性粉剂1500倍液，或20%三唑酮乳油2000倍液。隔10天左右喷一次，防治1～2次。注意在采收前20天停止用药。
（3）韭菜迟眼蕈蚊
别名韭蛆，为小型蝇类。幼虫聚集在韭菜的地下部和柔嫩的茎部危害，使内茎腐烂，叶片枯黄而死。
防治方法： 发现叶尖开始发黄变软并逐渐向地面侧伏时，应采用64%毙杀乳油1500-2000倍液，或5%高效大功臣可湿性粉剂1000倍液、1.8%爱福丁乳油2000倍液喷施，交替使用。
（4）葱蚜
又称台湾韭蚜。
防治方法：采用黄板诱杀蚜虫或银灰色薄膜驱蚜；
